Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Pde6cQ91ZQ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Pde6cQ91ZQ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Pde6cQ91ZQ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Pde6cQ91ZQ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Pde6cQ91ZQ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Pde6cQ91ZQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Pde6cQ91ZQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6cQ91ZQ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pde6cQ91ZQ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6cQ91ZQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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