Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf6Q91YR7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf6Q91YR7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf6Q91YR7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms