Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdha8Q91Y12 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdha8Q91Y12 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms