Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdha9Q91Y11 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha9Q91Y11 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha9Q91Y11 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms