Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trub2Q91WG3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trub2Q91WG3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trub2Q91WG3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms