Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pth2Q91W27 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pth2Q91W27 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms