Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tdrd3Q91W18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd3Q91W18 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd3Q91W18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms