Protein–RNA interactions for Protein: Q91V57

Chn1, N-chimaerin, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn1Q91V57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chn1Q91V57 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chn1Q91V57 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chn1Q91V57 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms