Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc71Q8VEG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc71Q8VEG0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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