Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpcsQ8VDG5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpcsQ8VDG5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpcsQ8VDG5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpcsQ8VDG5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PpcsQ8VDG5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpcsQ8VDG5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpcsQ8VDG5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpcsQ8VDG5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpcsQ8VDG5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms