Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn4Q8VCH8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms