Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tut1Q8R3F9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tut1Q8R3F9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms