Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CcsapQ8QZT2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CcsapQ8QZT2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CcsapQ8QZT2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CcsapQ8QZT2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CcsapQ8QZT2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CcsapQ8QZT2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CcsapQ8QZT2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CcsapQ8QZT2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CcsapQ8QZT2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms