Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc12Q8K5B8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms