Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hecw1Q8K4P8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Hecw1Q8K4P8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw1Q8K4P8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms