Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufs8Q8K3J1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs8Q8K3J1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufs8Q8K3J1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms