Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd2Q8K2Z4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd2Q8K2Z4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms