Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paf1Q8K2T8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paf1Q8K2T8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paf1Q8K2T8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms