Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud6bQ8K2H2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud6bQ8K2H2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms