Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt1Q8K297 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Colgalt1Q8K297 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Colgalt1Q8K297 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colgalt1Q8K297 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colgalt1Q8K297 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colgalt1Q8K297 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms