Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1B8

Fermt3, Fermitin family homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt3Q8K1B8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fermt3Q8K1B8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fermt3Q8K1B8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms