Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ago4Q8CJF8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ago4Q8CJF8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ago4Q8CJF8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms