Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf628Q8CJ78 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf628Q8CJ78 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf628Q8CJ78 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms