Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20aQ8CID3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20aQ8CID3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms