Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tcerg1Q8CGF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tcerg1Q8CGF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcerg1Q8CGF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcerg1Q8CGF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tcerg1Q8CGF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms