Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brf1Q8CFK2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brf1Q8CFK2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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