Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc28aQ8CEI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms