Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc17Q8CE13 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc17Q8CE13 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc17Q8CE13 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms