Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rsph6aQ8CDR2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph6aQ8CDR2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rsph6aQ8CDR2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms