Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vcpip1Q8CDG3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcpip1Q8CDG3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms