Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Riox2Q8CD15 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riox2Q8CD15 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riox2Q8CD15 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riox2Q8CD15 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms