Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ufl1Q8CCJ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ufl1Q8CCJ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ufl1Q8CCJ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms