Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms