Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nhsl1Q8CAF4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nhsl1Q8CAF4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Nhsl1Q8CAF4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nhsl1Q8CAF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nhsl1Q8CAF4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms