Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4aQ8C9S8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4aQ8C9S8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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