Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C5C9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8C5C9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C5C9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C5C9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C5C9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C5C9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C5C9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms