Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc169Q8BXX9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc169Q8BXX9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc169Q8BXX9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms