Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor1Q8BX46 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Skor1Q8BX46 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skor1Q8BX46 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms