Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbbp5Q8BX09 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp5Q8BX09 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms