Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Triml1Q8BVP1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Triml1Q8BVP1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms