Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx17Q8BVL3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx17Q8BVL3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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