Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smad3Q8BUN5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms