Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gga3Q8BMI3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga3Q8BMI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms