Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc4Q8BKW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms