Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dupd1Q8BK84 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms