Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vipas39Q8BGQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vipas39Q8BGQ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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