Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGN9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGN9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGN9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGN9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGN9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8BGN9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms