Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnpo1Q8BFY9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo1Q8BFY9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnpo1Q8BFY9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms