Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim65Q8BFW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms