Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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H2-M10.4Q85ZW8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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H2-M10.4Q85ZW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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H2-M10.4Q85ZW8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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H2-M10.4Q85ZW8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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H2-M10.4Q85ZW8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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